MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Liberibacter crescens BT-1 chromosome

Total Repeats: 6663

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019907	ATG	2	6	1366	1371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019907	GAAA	2	8	4734	4741	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019907	T	6	6	5631	5636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019907	A	6	6	5654	5659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019907	TAA	2	6	5666	5671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019907	AGA	2	6	5676	5681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019907	TATC	2	8	9893	9900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019907	ATTA	2	8	9908	9915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019907	TAA	2	6	9972	9977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019907	T	6	6	9992	9997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019907	AAT	2	6	10004	10009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019907	GTAA	2	8	10024	10031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019907	A	6	6	10698	10703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019907	ATG	2	6	10770	10775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019907	AGA	2	6	10821	10826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019907	T	7	7	10902	10908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019907	GCT	2	6	10937	10942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019907	AAAAT	2	10	10945	10954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019907	TA	3	6	10966	10971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019907	ATA	2	6	10989	10994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_019907	AGAA	2	8	11023	11030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019907	ATG	2	6	11035	11040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019907	AGA	2	6	11049	11054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019907	AATA	2	8	11082	11089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019907	TAAT	2	8	11097	11104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019907	ATG	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019907	TTTC	2	8	12280	12287	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019907	TCA	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019907	GGA	2	6	12315	12320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019907	TTA	2	6	12341	12346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019907	TGA	2	6	12362	12367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019907	A	6	6	12423	12428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019907	GTA	2	6	12442	12447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019907	TGA	2	6	12452	12457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019907	AGAAAA	2	12	12466	12477	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019907	GAAAT	2	10	12478	12487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019907	TTA	2	6	12495	12500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019907	TAAA	2	8	12505	12512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019907	AT	3	6	12514	12519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019907	TTA	2	6	13108	13113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019907	TAT	2	6	13123	13128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019907	GAT	2	6	13147	13152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019907	AGA	2	6	13156	13161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019907	A	6	6	13197	13202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019907	TAA	2	6	13228	13233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019907	TAA	2	6	13298	13303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019907	TTTTA	2	10	13320	13329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019907	TAA	2	6	13362	13367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019907	TAA	2	6	13373	13378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019907	CAT	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_019907	AAAAT	2	10	13437	13446	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019907	AT	3	6	13476	13481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019907	ATA	2	6	13496	13501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019907	AT	3	6	15970	15975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019907	CAGAT	2	10	15993	16002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_019907	T	6	6	16002	16007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019907	TTA	2	6	16673	16678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019907	TTC	2	6	17979	17984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019907	ATT	2	6	17997	18002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019907	AT	3	6	18704	18709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019907	ATA	2	6	18726	18731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019907	AT	3	6	18740	18745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019907	TA	3	6	20799	20804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019907	TAAAA	2	10	20807	20816	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019907	A	6	6	20813	20818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019907	AAG	2	6	20836	20841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019907	AT	5	10	20847	20856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019907	TAA	2	6	20880	20885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019907	TTAA	2	8	20899	20906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019907	ATT	2	6	21405	21410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019907	AGTT	2	8	21428	21435	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019907	TAC	2	6	21458	21463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_019907	A	7	7	21481	21487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019907	TAA	2	6	30036	30041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019907	AAG	2	6	30066	30071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019907	ATTA	2	8	31228	31235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019907	ATTTA	2	10	31244	31253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019907	TAAT	2	8	32876	32883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019907	CAA	2	6	32942	32947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_019907	A	6	6	32946	32951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019907	TA	3	6	33004	33009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_019907	AGTT	2	8	33044	33051	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019907	TAACT	2	10	33055	33064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_019907	A	6	6	33076	33081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019907	A	7	7	33084	33090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019907	GAA	2	6	33130	33135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019907	AT	3	6	33151	33156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019907	TATT	2	8	33201	33208	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_019907	T	6	6	33229	33234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_019907	ATTT	2	8	33248	33255	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019907	TAA	2	6	33258	33263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019907	T	6	6	33264	33269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019907	AAT	2	6	33280	33285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019907	T	6	6	33302	33307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019907	TAA	2	6	33330	33335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019907	TA	3	6	36200	36205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019907	ACA	2	6	36251	36256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_019907	TAA	2	6	36261	36266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019907	ATA	2	6	36277	36282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019907	TAC	2	6	36292	36297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019907	AAT	2	6	38144	38149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019907	ATT	2	6	38150	38155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019907	ATAATT	2	12	38178	38189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019907	GTAGAA	2	12	38218	38229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019907	TAAAA	2	10	39711	39720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019907	TTA	2	6	39743	39748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019907	AAT	2	6	39802	39807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019907	TTGA	2	8	39810	39817	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019907	ATAGA	2	10	40383	40392	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019907	A	6	6	40424	40429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019907	T	6	6	40435	40440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019907	TAA	2	6	40442	40447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019907	AAG	2	6	42083	42088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019907	GAA	2	6	42104	42109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019907	AT	3	6	42160	42165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019907	AG	3	6	42169	42174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019907	CAT	2	6	42202	42207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_019907	AAT	3	9	42208	42216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019907	TAT	2	6	42225	42230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019907	AGT	2	6	42283	42288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019907	T	7	7	44963	44969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019907	T	6	6	44980	44985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019907	CTT	2	6	46334	46339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_019907	T	6	6	46343	46348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019907	AAG	2	6	46355	46360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019907	TAA	2	6	46389	46394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019907	AGTTA	2	10	46742	46751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019907	T	6	6	46971	46976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019907	TGT	2	6	49140	49145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019907	TA	3	6	49238	49243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019907	AGA	2	6	49279	49284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019907	TA	3	6	49303	49308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019907	T	6	6	49314	49319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019907	TTAA	2	8	49351	49358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019907	AGA	2	6	49367	49372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019907	A	7	7	49372	49378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019907	TAA	2	6	49386	49391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019907	TAT	3	9	49399	49407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019907	TATTTT	2	12	49418	49429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019907	T	7	7	49426	49432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019907	CTTT	2	8	49451	49458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019907	TA	3	6	49482	49487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019907	T	7	7	49503	49509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019907	TTA	2	6	49520	49525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019907	GTT	2	6	49545	49550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019907	AT	3	6	49582	49587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019907	AAG	2	6	49588	49593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019907	AT	4	8	49594	49601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019907	T	6	6	50107	50112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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